微信现在不能买彩票吗:PyMOL及其插件安裝教程

PyMOL及其插件安裝教程

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安裝PyMOL軟件

PyMOL軟件是一款用Python語言開發的開源的分子三維結構顯示軟件,被廣泛運用于科學研究與教育領域。它由Warren Lyford DeLano開發,現由Schrodinger公司提供技術支持。

這里介紹兩種安裝方法:

1、 使用綁定Python(這里以3.7版本為例)的PyMOL安裝包安裝

下載地址:

Windows版本:https://pymol.org/installers/PyMOL-2.3.1_0-Windows-x86_64.exe

Linux版本:https://pymol.org/installers/PyMOL-2.3.1_75-Linux-x86_64-py37.tar.bz2

Windows版本直接雙擊安裝,Linux版本則是解壓到任意有權限訪問的目錄,比如/home/yinfotek。

2、 使用Anaconda安裝

Anaconda是一個開源的包、環境管理器,包含了大量安裝好的Python工具包,非常便于科學計算編程和分析。

下載地址:https://www.anaconda.com/distribution/#download-section

其安裝非常簡單,這里以Python3.7版本為例。Windows下只要下載安裝包Anaconda3-2018.12-Windows-x86_64.exe,雙擊即可;Linux下則使用shell運行安裝腳本Anaconda3-2018.12-Linux-x86_64.sh,然后按照提示進行下去(假設安裝目錄為/home/yinfotek/anaconda3)。

注意,Linux下需要設置環境變量,如export PATH=/home/yifnotek/anaconda3/bin:$PATH

如果已經安裝了Anaconda,那么,使用下面的命令來安裝PyMOl就非常方便了。

Windows系統下,打開dos命令提示符,然后運行命令:conda install -y -c schrodinger pymol

Linux系統下,運行下面命令:conda install -y -c schrodinger pymol

如果出現下載超時,只要重試即可?;虻鍬糷ttps://anaconda.org/schrodinger/pymol/files,下載pymol-2.4.0a0-py37_1.tar.bz2包,放至本地目錄,再用conda命令安裝:conda install -y –use-local pymol-2.4.0a0-py37_1.tar.bz2

安裝center_of_mass.py插件

只要將center_of_mass.py文件復制到Python安裝目錄的Lib文件夾里即可。

Windows系統

若PyMOL安裝在C:\User\yinfotek\PyMOL,則插件的放置目錄是:C:\Users\yinfotek\PyMOL\Lib

若Anaconda安裝在C:\Users\yinfotek\Anaconda3,則插件目錄是:C:\Users\yinfotek\Anaconda3\Lib

Linux系統

若PyMOL安裝在/opt/pymol,則插件目錄為:/home/yinfotek/pymol/lib/python3.7

若Anaconda安裝在/home/yinfotek/anaconda3,則插件目錄是:/home/yinfotek/anaconda3/lib/python3.7